近年來，通化市認真落實全省民營經濟騰飛計劃，以擴大總量、優化結構、提高質量為目標，以體制創新、科技創新和管理創新為動力，推動民營企業在創新中發展，在發展中創新，全市民營企業的活力不斷增強，呈現出一派生機蓬勃的局面。

2012年，通化市民營經濟實現增加值474.1億元，占全市生產總值的53.8%，上繳稅金66.3億元，占全口徑財政收入的62.5%。

從瀕臨破產的老國有企業到打造名牌產品“苦碟子”，擁有多家子公司的華夏集團從擺脫困境到發展壯大的過程，就是管理創新的過程。華夏集團的前身，是通化資格最老、有1000多人的制藥企業大廠——通化白山制藥廠。這個藥廠曾經以生產青霉素、鏈霉素、慶大霉素等藥品而全國聞名，但在激烈的市場競爭中，面臨倒閉，于是政府決定啟用原通化縣塑料廠廠長華玉強擔任廠長。華玉強上任后，首先解決的就是管理問題。

打破國有體制下的員工只進不出的管理模式，建立起員工、企業雙向選擇的用工制度，一次性裁員47人。裁減領導班子，實行競聘上崗。打破級別工資制度，實行崗位工資。改造針劑車間，提升生產工藝水平，漸漸使企業走出了困境。

東寶集團，這個由2萬元起家的小企業，在管理創新上，卻始終走在時代的前頭。第一個打破工人8級工資制，實行計件工資；第一個以集體企業兼并國有企業，先后兼并了通化縣木器廠、人造板廠、食品廠、白山制藥二廠等。1992年，組建了通化東寶集團，又兼并了集團所在地通化縣恒德村，在國內首創“以企兼農”典型范例。1994年，集團又上臺階，成功上市，完成了企業的原始積累、資本運作和隊伍壯大。為了實現讓外國人用上中國藥的戰略目標，于2007年，又收購了通過美國FDA和歐盟EMEA雙認證的瑞典瑞康生物技術有限公司，從而使東寶擁有了一個國際化的生產基地和綠色通道。

吉林萬通集團，這個昔日幾近破產的國有企業改制后，在董事長潘首德的帶領下，歷經15年的創新發展，目前已擁有三大板塊產業：第一板塊產業是通化萬通藥業股份有限公司、長春萬通藥業股份有限公司、梅河萬通藥業股份有限公司、鄭州萬通藥業股分有限公司、鄭州萬通復升藥業股份有限公司、河北萬通金牛藥業股份有限公司、萬通集團藥品經銷公司6戶醫藥企業；第二板塊產業為萬通生物工程股份有限公司、通化萬通小額貸款公司、通化萬通房地產股份有限公司、通化萬通大酒店、中國萬通俄羅斯銷售公司、中國萬通印尼銷售公司、萬通集團天露葡萄酒股份有限公司、萬通集團清水麗人化妝品股份有限公司；第三板塊產業為通化萬通礦業集團及屬下七戶礦業企業。集團先后躋身全國藥業百強和中國醫藥制造業納稅百強企業行列。榮獲國家重點高新技術企業、國家火炬計劃重點項目企業、國家級企業技術中心、中國優秀民營科技企業、榮獲全國第十七屆管理創新成果獎，全國守合同、重信用企業、全國模范勞動關系和諧企業、中國產品質量“AAAAA”級信譽企業、國家級農業產業化重點龍頭企業、省市納稅狀元等百余項殊榮。集團黨委被授予“全國先進基層黨組織”、全國非公有制企業“雙強百佳黨組織”、“雙愛雙評先進企業”光榮稱號。萬通商標榮獲“中國馳名商標”。

多年來，通化圍繞創新型城市目標，大力實施創新驅動戰略，積極促進創新要素向企業集聚，使企業成為技術創新活動的主體和創新成果獲益的主體，逐步形成“政府扶持創新、創新服務企業、企業自主創新、創新升級產業”的良好氛圍。2012年，通化市獲得吉林省首批創新型試點市，是省內唯一獲此殊榮的地級城市。